斗罗大陆3龙王传说故事结束一万年后，冰化了，斗罗联邦科考队在极北之地科考时发现了一个有着金银双色花纹的蛋，用仪器探察之后，发现里面居然有生命体征，赶忙将其带回研究所进行孵化。蛋孵化出来了，可孵出来的却是一个婴儿，和人类一模一样的婴儿，一个蛋生的孩子。
故事发生在明治四十年（1907 年）在京都伏见居住的百川稻子什么都不擅长，每天都被父亲责骂，对于她来说的救赎就是祈祷神佛，某天一如往常她前往伏见稻荷神社参拜神明，遇到了一位自由奔放的少年坂本喜八，坂本喜八对稻子说不要信这些看不见的东西，从今之后将是电气时代。而此时稻子的 父亲对稻子说了关于结婚的事情，而且是父亲单方面决定的，稻子本来是放弃抵抗认为自己的价值就是如此，但坂本喜八打开了稻子想要离开这个家的心声，带着稻子离开了这个封闭的家。阻止结婚的方法是找出奇书《二十世纪电气目录》，那是喜八童年时代写下的关于电气的预言书，而喜八过去的哥哥清六带走这本书之后下落不明，喜八和稻子为了寻找这本奇书在京都和滋贺等地逃窜，消失的“电气目录”和其背后隐藏的秘密都等待揭开。
最近一段时间，动物城里诡异事件接连上演——织布鸟公寓幽灵出没、鹿灵灵在舞台上意外晕倒、被绑架者凭空消失、世纪名画喵娜丽莎离奇失踪、鲸鱼岛的神秘传说悄然成真……这一切难道只是巧合吗？市民们人心惶惶，不过好在，大名鼎鼎的牧奇尔侦探就生活在这里。他带领助手垂垂兔、探员平头哥，奔赴每一处现场，搜寻暗藏的蛛丝马迹。可是直到真相浮出水面，犯人抓捕归案，他们才发现，众多案件背后，似乎一直有个神秘人在操控着一切！神秘人到底是谁？他的目的究竟是什么？这个夏天，跟随牧奇尔侦探，奔赴惊险刺激的破案之旅吧！
“第一次”是“无论多少次”——。
