斗罗大陆3龙王传说故事结束一万年后，冰化了，斗罗联邦科考队在极北之地科考时发现了一个有着金银双色花纹的蛋，用仪器探察之后，发现里面居然有生命体征，赶忙将其带回研究所进行孵化。蛋孵化出来了，可孵出来的却是一个婴儿，和人类一模一样的婴儿，一个蛋生的孩子。
中都凌霄阁试炼弟子兼扫地小厮杨开因资质不佳被贬为试炼弟子，三年内若无所成就将被逐出宗门。杨开偶然间获得了神秘石枕，开启了傲骨金身等神秘技能，在其后不断修炼，以其少年人坚韧不屈的性格突破自身极限，最终站到了传承洞天的顶端。杨开与苏颜一同继承了玄妙功法，接续开启他成为传奇触及武炼巅峰的故事。
罗峰背负超凡的责任，正式踏足武者世界，与众多高手汇聚一堂，组成战队再上征途，保卫神州。一路修行，挡我者一战便是。
当熊猫阿宝为成为真正的神龙大侠做准备的时候，他的生父——熊猫李山突然到访。与此同时，拥有神秘力量的反派天煞登场，妄图制服所有高手，统治武林。相传在与世隔绝的熊猫村有着对抗天煞的力量，为了拯救苍生，阿宝与父亲踏上了归途，而阿宝的好伙伴悍娇虎、金猴、灵蛇、螳螂则一同拖延天煞，阿宝不仅肩负着成为真正的熊猫大侠的使命，还要让村民美美等新伙伴练就新功夫，继承乌龟大师的遗志，共同抵挡天煞。
第二部剧情自力石死后矢吹丈终于东山再起开始，到原作的最后与孟德萨拉之战中，矢吹丈“化为白色的灰烬”结束
