C.E.70年2月，地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月，在“非我即敌”的观念驱使下，地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。当战斗进行到最激烈的时候，少年真飞鸟失去了父母和妹妹。唯一的遗物就只有妹妹掉落的手机。获救之后，背负着家仇的真黯然离开了故土奥布前往PLANT。两年后，他成为了ZAFT的战士......
这是个异形生物所支配的世界。人类处于生物链最下端，面临灭绝的危机。某一天，森林的守护者·格雷姆与一名人类少女相遇，故事也就此展开。森林守护者与人类女孩之间，如同父女之间的羁绊又将描绘出一篇怎样的故事呢？
