世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击，现在启动
君原姬乃（深川芹亚 配音）是一个个性十分温柔和蔼的平凡高中女孩，然而，和其他女高中生不一样的是，姬乃是拥有一半人类身体和一半马的身体的半人马族。虽然过着和普通人类一样的生活，但实际上，姬乃对自己独特而又庞大的体型十分的在意和苦恼。大大咧咧开朗活泼的龙人狱乐希（桑原由气 配音）、成熟稳重总在关键时刻扮演军师角色的角人名乐羌子（白石晴香 配音）、天生就拥有着领导的气魄的翼人御魂真奈美（镰仓有那 配音）、理性沉稳的南极蛇人萨斯萨斯索（绫濑悠 配音），这些半兽人们都是姬乃的同班同学，每天，她们都聚在一起，过着充满了快乐的校园生活。
藤沼悟（满岛真之介 配音）拥有着能够回到过去的特异功能，母亲佐知子（高山南 配音）被害，曾经信赖的朋友白鸟润（水岛大宙 配音）即将作为儿童连续杀人案的真凶被处以死刑，在这个节骨眼上，悟忽然回到了1988年，回到了当时就读的小学。
天下第一奇门传人楚尘，学成下山途中，意外封印了自己的双魂五魄，当了五年的傻子上门...
