《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
万年前，魔君为护所爱，孤身持上古四剑踏上天路，硬撼天道，崩碎本源，留下万古裂痕，自身陨落轮回。万年后，江辞携魔君转世之身重临世间，与月神洛清河再续宿命前缘，尘封万年的上古四剑相继破封出世。天道秩序欲抹除一切变数，傀儡分身布下天罗地网。他以弑神戟为锋，以四剑为阵，以一身傲骨逆天而行。何为天命？何为定数？若九天皆为牢笼，我便一剑破之！若天道执掌宿命，我便亲手逆之！
终于实现梦想，踏入 FX（外汇保证金交易）世界的大学生久留美。 而她这么做的理由，是为了夺回已故母亲在 FX 上赔光的 2000 万日圆。 「区区 2000 万，我一定要变得能轻松赚回来！」 如此发誓的她，一头栽进的是一个一夜之间就能在天堂与地狱之间翻转的世界。 未实现亏损、强制平仓，以及停不下来的心跳…… 即使如此，还是想买、想卖、想赚钱！ 萌智子、芽吹、安子—— 一群个性鲜明的 FX 战士也陆续加入，盘势越烧越旺！ 随着走势图起伏而时喜时忧，可爱却又有点（!?）危险的金钱游戏。 久留美等人，究竟能否在这个狂乱的世界中生存下去——！ ？
曾折断无数同龄球儿之心的、日本第一的初中生投捕组合·清峰叶流火和要圭，面对来自全国74所名门高校的热情挖角，竟然悉数拒绝、从此销声匿迹……并且出现在一所普通到不能再普通、且没有棒球部的都立高校？背后的原因，竟然是因事故失忆的要圭？
天才少年变废柴遭家族排挤，未婚妻竟上门当众退婚；萧炎为雪前耻立三年之约，一句豪言震惊全场：“三十年河东，三十年河西，莫欺少年穷！”在师父药老的帮助下，陨落天才开启了的传奇逆袭之路！
所谓的“交流障碍症”——
三眼国王要占领魔方市，失误将神奇能量道具散落各处，而皮皮鲁恰巧通过神奇能量道具意外闯入缩小玩具世界，重启冒险之旅！一场神奇能量带来的奇妙体验，一场重创三眼国王阴谋反击战拉开序幕！
