《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
三千位面守护者女主神绫清玄意外死亡，为了寻回和记忆，把小黑莲男主染回小白莲，女主神用她的实际行动告诉围绕在生命男主身边的飞蛾们：无论哪个世界，我都是永远的神！
陈默看见飞机上所有人的头顶都是“零”。四十分钟后，飞机坠毁。从那一天起，他和林晚开始用这双眼睛对抗死亡。他们扳倒过凶手，躲得过意外，却挡不住生老病死。直到自己的头顶也亮起“二”，才发现这世上还有一个人和他一样能看见死期——而那个人，正在策划一场只属于他们的归零。
将清纯可人的“租借”女友·水原千鹤介绍给家人和朋友，谎称她是“真”女友的废柴大学生·木之下和也。
在无法说出真相的情况下，和也继续维持着这段“虚假”的关系。在共同经历各种事件的过程中，他内心对千鹤的“真实”感情日益加深。
