《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
他，国民级游戏天外江湖中的传说，“全球争霸赛第一人”“亿万玩家的精神领袖““第一帮派领导者”......鲜衣怒马少年得意之时，惨遭背叛，走下神坛逃离游戏世界，从此消失匿迹。 多年后，一个自称来报恩的少年出现了......
蛇妖许黑诞生灵智后，因偷食陈家镇的猪闯入猪圈，恰巧遇上被混混扔进来、后被仙人夺舍重生的陈凡。许黑误将陈凡当作可怕的捕蛇人，情急之下吞了他，却没想到陈凡在其腹中不仅没死，还试图夺取他的妖核。一番争斗后，许黑妖核破裂、身受重伤。危急时刻，陈凡的妖族至宝妖神鼎意外吸收了许黑的妖核碎片，反将陈凡吞噬。最终，许黑在光效作用下身体逐渐修复，倒影化作蛟龙。
东方桃子是一名平凡而普通的小女生。一天放学后，她无意中获得一本神奇的花语星卡笔记，通过这本笔记,桃子发现了世间存在一种诞生于自然界的精灵。这些精灵呈兽形或者人形，拥有强大的自然力量，不加以控制会给我们的生活制造出很多麻烦。但是有一种人，能够与精灵沟通，并使用星卡收服精灵，控制和使用它们的力量，我们称之为星卡师。为了解决黑化精灵们造成的麻烦，东方桃子通过努力学会净化精灵的力量，成为了星卡师的一员。并得知自己身负花语公主血脉力量，拥有净化黑化精灵，拯救精灵的重要使命！在收服和了解精灵的过程中，她还收获了两个伙伴
