《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
末世降临，人类觉醒异能，对抗一个个高塔中的怪物。然而，有一个最强BOSS坐镇在高塔最高处——魔王·鸠命，他是人类无法逾越的天堑。一个个勇者们前仆后继，总以为自己就是故事中的主角，可主角光环从未在他们身上降临。当主角们失去了主角光环，就不再是主角。
毕业后一事无成的韩烈向上天许愿：如果一切能重来，消费系统降临，他竟然真的回到了十八岁！技能不够用？用积分升级！长相太一般？用积分捏脸！教训找茬的富家哥，俘获女神们的芳心。重生一场，且看韩烈如何逆袭，青云直上！
架空战国时代的日本被未知生命体“鬼神”统治已有150年，唯有“武士团”反抗其统治，一直不懈抗争。武藏和小次郎也曾向往着武士，发誓有朝一日结成最强的武士团。可是，他们所生活的城镇却将鬼神奉为神明，将武士视为异端。武藏只能将梦想藏在心中，直到有一天，他遭遇了人类被鬼残忍杀害的一幕。为了重拾与小次郎的誓言，武藏向强大的鬼发起了挑战…！
