《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
林风从小背负叛徒之子的罪名，受尽欺凌辱骂。绑定穿越诸天掠夺系统的他强势崛起，就算所有人都觉得我是坏人又怎样？我只走我自己的路，穿越诸天，掠夺外挂，打脸反派，升级反杀。我要让所有人都不敢再看不起我！我要为父母洗清罪名！
在充满奇幻能量与多元生命形态的异世界中，青年守护者唐卡凭借独特的感知能力"星辰之眼"维护不同族群间的和谐共处，少女庄小冉突发意外，觉醒了能与神秘能量产生共鸣的特殊体质，踏入这个奇妙的异世界。被唐卡救助后，两人在相处中发现了她的身世之谜，因此揭开两个古老组织"自然守护团"与"生命议会"的理念碰撞。
喜屋武历（畠中祐 配音）是一位非常热爱滑板运动的少年，对于名为“S”的滑板竞技比赛格外的热衷，一次偶然中，历和名为驰河兰加（小林千晃 配音）的加拿大转学生一起参加了被称为“BEEF”的滑板决斗，就此被卷入了一段疯狂的经历之中。
天下第一奇门传人楚尘，学成下山途中，意外封印了自己的双魂五魄，当了五年的傻子上门...
