《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
住在安第斯山脉的印第安男孩佩佩罗在十岁生日的第二天目睹了传说中的“黄金秃鹰”，并踏上了前往黄金城埃尔多拉多的旅程，据说那里有可以拯救穷人的宝藏。这次旅程也是为了寻找七年前前往黄金国后失踪的父亲卡洛斯的下落，以及在看到“黄金秃鹰”那天遇到的女孩奎娜失去的记忆。
在一个充满超能力与可怕危机的世界，是超级英雄守护着世界的安定。而从出生就被判为无能力者的周舜天，非常渴望成为拯救世界的英雄。在一次意外中，他无意间获得了与超能力完全不同的力量，从此成为另类英雄的他，用自己的方式守护着世界，保护着家人和伙伴，但在他身上，似乎还隐藏着不为人知更大的秘密……
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