突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
苏临晚穿越成臭名昭著的稀有向导，原主以摧残哨兵精神力为乐。她连夜逃出基地，只想在荒星苟活。可那些曾被伤害的哨兵却一个个找上门，眼神再没了恨意。她用耐心与善意帮他们安抚精神体，没想到这群桀骜不驯的“疯批大佬”全乖了。她叹气：我只想苟活，怎么就成了全星际最野的驯兽师？
