突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
天地异变，妖兽横生，新纪元人类诞生了一种全新的职业。收服怪物，培养怪物，训练怪物，这就是御使。一个怀揣着梦想的少年懵懵憧憧的被一脚踢入这个黄金盛世。高鹏：就算是一条泥鳅，我也能将他进化成一只翱翔九天的真龙。
key社的四季轮回系列作品之秋篇（另外三部是：春篇《团子大家族》，夏篇《鸟之诗》，冬篇《雪之少女》）。
以「魔女」备受景仰的城市为舞台。背负着棺材的男人与双眼有如野兽的少女在此现身，他们追寻的猎物唯有「魔女」而已。当邪恶的「魔女」碰上飢饿的「野兽」，华丽又激烈的战斗就此揭开序幕！
