人类殖民星球遭到外星人库克托尼亚人的袭击，守护驻军被消灭，留下 13 名儿童。故事讲述他们乘坐地球军事训练舰“Janus”号，与使用名为“Roundburnians”的人形武器的外星人作战，以拯救被外星人俘虏的家人和朋友。故事根据儒勒·凡尔纳的小说《两年假期》（男生称之为“两年假期”）改编。宇宙版《少年的假期》的构思是在《机动战士高达》的企划过程中产生的，但随着《高达》走向了不同的方向，本作是以此为主题的新动画，因此富野由悠季的名字被冠以“原作作者”之名。
故事发生在神世纪300年，主要讲述结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。
第1话：勇者王新生
在一片终日不见光明的大陆“琥珀之地”上，有一个神圣的职业——信蜂。在这片人工太阳照耀不到、蔓延着黑暗的危险之地，信蜂赌上性命也要为国民递送重要的“信件”。高修（福山润 配音）就是一名优秀的信蜂，这天他要送递的“信件”是一名叫拉格（泽城美雪 配音）的少年。拉格的母亲于某日被一群陌生人强行带走，拉格的母亲将他作为信件，送往外海小镇的婶婶家。运送途中，拉格为高修那颗坚强而温柔的心所吸引。因为崇敬高修，拉格决心要成为一名优秀的信蜂。12岁时他通过考试成为信蜂，却意外发现高修已经不再是信蜂，而且失去了“心”，下落不明。拉格踏上信蜂之路，递送着人们“心”和“希望”的信件，他要找到高修……
