人类殖民星球遭到外星人库克托尼亚人的袭击，守护驻军被消灭，留下 13 名儿童。故事讲述他们乘坐地球军事训练舰“Janus”号，与使用名为“Roundburnians”的人形武器的外星人作战，以拯救被外星人俘虏的家人和朋友。故事根据儒勒·凡尔纳的小说《两年假期》（男生称之为“两年假期”）改编。宇宙版《少年的假期》的构思是在《机动战士高达》的企划过程中产生的，但随着《高达》走向了不同的方向，本作是以此为主题的新动画，因此富野由悠季的名字被冠以“原作作者”之名。
在前两季里，小咖结识了一群秘密的朋友：来自未来的汽车变形机器人——咖宝车神，它们只在小咖面前才会露出庐山真面目。咖宝车神们凭着超群的高智能和先进的未来科技，发挥神奇力量，帮助小咖战胜各种困难，并时刻守护着他。小咖和咖宝车神们经常秘密地帮助着人们，经历了许多有趣又惊险的故事，小咖也因此收获了不少经验值。假日的一天，小咖一家到海边游玩。小咖发现了一只迷路的小动物和妈妈分开了，他照料好小动物，并帮助它回到妈妈身边。次日清早，小咖发现远处的海上有轮船正在冒出滚滚浓烟，不断拉着汽笛求救，情况危急，小咖立刻召唤出咖宝车神，一如既往地发挥他的分析力、领导力和协作力，指挥咖宝车神及时展开海上救援，咖宝车神施展最强本领，使用炫酷的未来装备解决危机……在新的一季中，小咖将会迎来怎样的挑战和更多有趣的奇遇呢？
