自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
被众人誉为杰作的漫画《PLUTO 冥王》改编自手冢治虫于 1964 年推出的《Astro Boy ‘The Greatest Robot on Earth’》，由浦泽直树（《20 世纪少年》《以柔克刚》《危险调查员》）与其长期创作伙伴长嶝高士联合创作。
和泉（梅田修一朗 配音）是一个拥有不幸体质的男生，总是会莫名其妙的被卷入到各种各样的麻烦之中。虽然倒霉连连，但和泉性格乐观开朗，不管发生怎样的灾难，都不会唉声叹气。式守（大西沙织 配音）是和泉的女友，表面看来，式守温温柔柔，非常的容易相处，但一旦和泉遇到了什么麻烦事了，式守就会立刻改变往日的风格，露出让人意外的一面。
