自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
这是一个灵气为王的世界，谁拥有吞天噬月的灵力，谁就是大主宰！ 大千世界，万道争锋。主宰之路，谁主沉浮？ 少年牧尘，资质卓绝，出生于北灵境九大域之一牧域。父亲是牧域之主牧锋，如今已是北灵盟盟主，母亲清衍静是浮屠古族的神女，在其年幼时为保护儿子和丈夫而被迫离开。从此牧尘立下誓言，将来一定要找回母亲。 在经历腥风血雨后，解救母亲，成为浮屠古族的族长。在万古会中，牧尘成功获得万古不朽身，跻身大千世界颠峰层次的存在之一，为了拯救大千世界的生灵，牧尘闭关五年后，突破出关超脱圣品，与炎帝“萧炎”、武祖“林动”合力对战天邪神。他们消灭了为祸人间的邪族，并以世界之力净化被域外邪族夺走的另一半的大千世界。最终，牧尘成功在苍穹榜上留下完整真名，并将其命名为"主宰境"，与萧炎、林动一起成为大千世界的守护者。
