自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
在每一个角落都被探索完毕的世界中，唯一残留的秘境——大洞穴“深渊”。不知道延续到何方，深不见底的巨大纵向洞穴，栖息着奇妙奇怪的生物们，沉眠着现在的人类无法制造的贵重遗物。“深渊”那充满了不可思议的姿态吸引了人们，并驱使人们展开冒险。如此，多次挑战大洞穴的冒险者们，陆续得到了“探窟家”的名号。
片中的主人公是一头全身雪白、胖乎乎的北极熊，看似孔武有力的外表，却总是笨呼呼地搞砸一切。他从遥远的北极来到了繁华的城市，在新奇的际遇中，有着各式职业体验， 发生了一系列令人啼笑皆非的故事。
该机构与国际刑警组织合作，拿下一个组织严密的珠宝盗窃团伙；阿彻对此表示怀疑，因为他们的国际刑警组织联系人似乎把这次任务看得更像是一次试演。
