这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
星幻岛上的欢乐和谐的生活引起了一波邪恶势力的不满和觊觎。在海洋深处有一个神秘的魔幻岛，岛主是没有欢笑没有快乐的呼噜大王，正是由于星幻岛的生活充满了太多快乐，而惹怒呼噜大王，决心打乱班纳他们的生活。于是派出自己的手下：双双、失失、冒冒三人去到星幻岛完成这一艰巨的任务。麻烦还不止这些，海博士的老冤家死对头，功夫岛岛主大虾博士也对星幻岛垂涎已久。看来星幻岛这下可是真的面临棘手的问题了，不过你可别忘了我们还有可爱的班纳在呢，天大的困难在他的戏耍中都会迎刃而解的。班纳这个小家伙可是不好惹的，最后大坏蛋们只能是偷鸡不成反蚀把米，给自己造成了种种困扰和麻烦，还反倒给班纳和他伙伴们的生活增添不少新的乐趣。
