这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
在前两季里，小咖结识了一群秘密的朋友：来自未来的汽车变形机器人——咖宝车神，它们只在小咖面前才会露出庐山真面目。咖宝车神们凭着超群的高智能和先进的未来科技，发挥神奇力量，帮助小咖战胜各种困难，并时刻守护着他。小咖和咖宝车神们经常秘密地帮助着人们，经历了许多有趣又惊险的故事，小咖也因此收获了不少经验值。假日的一天，小咖一家到海边游玩。小咖发现了一只迷路的小动物和妈妈分开了，他照料好小动物，并帮助它回到妈妈身边。次日清早，小咖发现远处的海上有轮船正在冒出滚滚浓烟，不断拉着汽笛求救，情况危急，小咖立刻召唤出咖宝车神，一如既往地发挥他的分析力、领导力和协作力，指挥咖宝车神及时展开海上救援，咖宝车神施展最强本领，使用炫酷的未来装备解决危机……在新的一季中，小咖将会迎来怎样的挑战和更多有趣的奇遇呢？
