随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
少年莫阳从备受欺凌的宗门废物，逆袭成长为觉醒远古血脉的强者的传奇故事。故事始于灵虚宗，莫阳因师父四长老之死而受尽同门羞辱，却在绝境中意外觉醒了体内封印的“星皇”传承，获得至宝“星皇塔”与无上功法《星皇经》。他自此叛出宗门，立志为师复仇，并踏上了追寻力量巅峰的道路。在旅程中，莫阳展现出惊人的炼丹天赋，以此积累资源，化解危机。他代表灵虚宗在四宗门武道盛会上一战成名，并因此结识了神秘宗门“乾宗”的师兄师姐，得知自己早已被一位神秘强者推算并收为弟子。莫阳进入玄天圣地，帮助圣女羽瑶复苏大帝遗留的“帝木”，并深入大荒山脉秘境，在那里获得了古神左眼的传承，正式确认了自己“太古神族后裔”的身份。
