随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
阿久津瑛太是一位孤独、内向的机甲宅男。他甚至还暗恋过一个女孩。她是吾妻真希奈，一位极其美丽、开朗且受欢迎的女孩。一天晚上，马基纳出现在瑛太家门口。她的身体似乎有些奇怪，当她突然露出赤裸的身体时……那是一个机械身体，而不是人类身体！ Makina 是一款专为性爱而打造的人工智能机器人，但其访问成人信息受到限制。 Eita 是一名处女，但对女性有洁癖，而且极其善良。他们两个开始一起生活，不允许任何人透露他们的真实身份！
一处位于乡下的宁静村庄，发生家畜陆续诡异死亡的奇妙案件。为了解决这起案件，一位穿着一身显眼服装，名叫「隐神」的男子，被从东京找来到此地。就在调查途中，男子与一名居住村内，被旁人叫「泥田坊」，有着神秘气息的少年相遇。一则波澜万丈的怪物物语，就此揭开了序幕──
