新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。变身！SHINKALION！
舞会中，史卡蕾特被第二王子凯尔宣告解除婚约，更被加诸莫须有的罪名以及〝恶役千金〞的称号，陷入遭众多贵族谴责的窘境。至今为止不断忍耐着的她，已经受够和愚蠢的凯尔继续交往了！怒上心头的史卡蕾特说出自己的请托——『请问方便让我在最后将各位打得落花流水吗？』
野原新之助今年5岁，是一个人小鬼大的小孩。他喜欢漂亮的姐姐，收养了一条棉花糖一样的流浪狗小白。小新的妈妈美冴是一个全职主妇，粗心而又有点神经质的她经
继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
