继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
东方桃子是一名平凡而普通的小女生。一天放学后，她无意中获得一本神奇的花语星卡笔记，通过这本笔记,桃子发现了世间存在一种诞生于自然界的精灵。这些精灵呈兽形或者人形，拥有强大的自然力量，不加以控制会给我们的生活制造出很多麻烦。但是有一种人，能够与精灵沟通，并使用星卡收服精灵，控制和使用它们的力量，我们称之为星卡师。为了解决黑化精灵们造成的麻烦，东方桃子通过努力学会净化精灵的力量，成为了星卡师的一员。并得知自己身负花语公主血脉力量，拥有净化黑化精灵，拯救精灵的重要使命！在收服和了解精灵的过程中，她还收获了两个伙伴
丁丁（科林·奥玛拉 Colin O'Meara 配音）是一名记者，他有着与1米37的身高完全不匹配的智慧和勇气，为了找到真相消灭罪恶，他和他的小狗白雪（苏珊·罗曼 Susan Roman 配音）穿梭在世界各地，结识了各种各样正义的朋友们。在动画里，由于一伙毒贩的犯罪行径，丁丁结识了他此生最好的朋友阿道克船长（大卫·福克斯 David Fox 配音），这命中注定的相遇也改变了二人的命运，从波涛汹涌的摩洛哥港口到酷热荒芜的撒哈拉大沙漠，丁丁和船长一路追随着罪恶的脚步，终于将贩毒团伙一网打尽，正义又一次获得了属于它的胜利！同时，丁丁也卷入了一场政治漩涡中去，他的好友阿尔卡扎将军（韦恩·罗布森 Wayne Robson 配音）一直受政敌的威胁，而在丁丁的帮助下，他终于推翻了前人的独裁统治，继而成为了一介宽容出色的统治者。
将清纯可人的“租借”女友·水原千鹤介绍给家人和朋友，谎称她是“真”女友的废柴大学生·木之下和也。
在无法说出真相的情况下，和也继续维持着这段“虚假”的关系。在共同经历各种事件的过程中，他内心对千鹤的“真实”感情日益加深。
