继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
《百变校巴13火星大冒险》动画片中，校巴卟卟带领大家冲出地球，飞向火星！在这颗神秘又古怪的星球上，校巴卟卟担起安全守护大使的责任，和小朋友们展开了趣味、刺激的冒险之旅。在火星遇到突发事件怎么办？呼叫校巴卟卟！百变校巴会变身各种形态，出现在小朋友身边解决问题。
