继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
羸弱的阿修罗少年有鱼目睹部落被屠后爆发惊人潜能，因而被先祖獠忌掳走。有鱼经獠忌地狱式的死炼折磨得以脱胎换骨，修炼成斗神五感和独特的斗魂之道。完成死炼后，有鱼与好友时雨重逢，但阿修罗弱肉强食的规则却将时雨迫害致死。意识到自身强大才是唯一的出路，有鱼踏上成王之路，决意成为至强者改写阿修罗规则！
