继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
西陵珩的女儿小夭与表哥轩辕玱玹、涂山世家公子涂山璟、神农义军将领相柳之间的恩怨情仇。不仅有刻骨铭心的爱情,更有家国天下的格局和濡沫共担的亲情和选择，谱就了一曲荡气回肠的相思曲。
威廉·沃尔夫并非普通的人类男孩。在精灵王国“万物工厂”的魔法世界里，他就是狼男孩。和新结识的精灵朋友们一起，他逐渐明白，自己丰富的想象力和无限的创造力拥有改变世界的力量。
