继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
深渊中，魔物冲出深渊，人类召唤英灵侵害对抗，楚休觉醒了英灵里最低级的灵器，被父亲唾弃、被少年弟弟感动、被众人为之，却凭借金手指万魂拂乾坤，不仅追查了屠杀自己深渊的人，同时还查到了母亲死亡的原因，并找到了母亲的真身，解开邪神教会不为人知的秘密，最终成为蓝星守护者。
猫眼三姐妹是专门窃取美术作品的盗贼集团，她们作案时总会留下带有猫眼三姐妹字样的卡片。被猫眼三姐妹所盗的美术作品都属于她们失散多年的父亲海因茨（一位著名的艺术收藏家）所拥有。犬鸣警察署刑警内海俊夫负责调查猫眼三姐妹的案子，但是逮捕行动却一次又一次因猫眼三姐妹逍遥法外而失败。来生瞳是内海俊夫的女友，经营一家同样名为“猫眼”的咖啡厅。内海俊夫却不知道，来生瞳即是猫眼三姐妹之一……
在即将坠入深洲的危急关头，辛灵被“神秘人”救出，意外来到了荒石被封印的地方。而荒石却在战斗中身受重伤，元神消散。为了救回荒石，叶罗丽战士们也行动起来，前往奇幻的仙境，开启全新的冒险之旅。在拯救荒石的过程中，辛灵带领孩子一起怀揣勇气与希望，再度探寻爱与成长的真谛。
温氏横行，生灵涂炭。江湖仙门义士发动“射日之征”，合力讨伐温氏。“夷陵老祖”魏无羡虽在推翻温氏中立下了汗马功劳，却因修非常道且太过强大而遭人忌惮坑害，致万人唾骂，被情同手足的师弟带人端了老巢，身陨形灭…… 十三年后，魏无羡被人献舍，并再度与姑苏蓝氏蓝忘机、云梦江氏江澄等旧人相遇，前尘谜团未消，江湖疑云再起。 而这一切恩怨情仇，都要从他们少年时说起……
