继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
万世轮回，世世灭门，万世至亲！无一生还！这一世，记忆苏醒，我，谭云，曾经的鸿蒙至尊，定要让欺辱我至亲的人，付出血的代价，整个世界都会在我的脚下颤抖！
“要和我结婚吗？为了守护住我们的单身生活。”在首都圈的旅行代理店JTC的企画部工作的拓也和莉香都不擅长人际交往，虽然平淡无华，但是各自过着充实的单身生活。随着公司打算在西伯利亚开设分店，单身者将会优先被派遣到海外，陷入困境的莉香向拓也提出了某个计划……几乎没说过话的两个人，在短短365天之后就要结婚了!?
故事发生在神世纪300年，主要讲述结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。
