继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
在点心公司工作的梦子，因一场事故失去了记忆。原本是自卑的化身、厌恶自己到不行的梦子，醒来后却变成了超级积极、自我肯定感MAX的性格。面对与原来性格截然相反的梦子，周围的人难掩困惑，但梦子积极直率的样子，开始一点点地带来变化——恋爱、工作、友情！还飘散着一丝事件的气息……？爆笑办公室恋爱喜剧！
百变校巴和小朋友开心的火星游学之旅继续展开。他们深入探访火星上的不同人造天穹，感受人类利用火星独特的地理环境与自然景观，积极开发和建设火星的创造性成果。他们参观天空天穹，感受作为地球和火星物资中转站的繁忙；来到未来的火星之肺生机天穹，参与拯救小蓝藻，重建生机天穹的任务；深入海洋天穹，探访在海底生活的各种仿生海洋生物。在他们的冒险中，灰灰哥哥引发各种大大小小的危机。这时，百变校巴变身多种形态，迎难而上，化解危机，让小朋友们火星游学之旅充满欢乐与笑声。
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地表上有着形形色色的动物，它们的外型与生态究竟是怎们来的呢？
