继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
2020 年 7 月 1 日。高中二年级的瑞穗正在度过最糟糕的17岁生日。我再也没有机会和我敬佩的前辈更亲近了，我的父母也完全忘记了我的生日……而且，由于不明传染病的爆发，社团比赛和修学旅行都被取消了，我觉得“我再也不会拥有‘闪亮的青春’了”。然而就在这时，他的青梅竹马木月突然宣称他是潜在男朋友。讲述主人公瑞穗与四个如家人般长大的青梅竹马之间的爱情故事。
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叶苍玄，举世无双炼体老祖，向诸神发起挑战。然而只差最后一步时，不幸在十万天劫中身毁陨落。数年后，叶苍玄再次苏醒，回到曾经的故乡，凡界沧州。两千六百多年未回，这里早已物是人非。曾一手创建的青玄宗遭奸人所害，门庭凋敝，任人宰割，昔日的故交好友更是生死未卜，不知所踪。既然回来，叶苍玄决定整顿昔日因果。曾经的他强大无比，如今依旧纵横天地。最终待一切了结，叶苍玄还会再次挑战，登上大道的巅峰！
传说曾有一个古老而神秘的图腾领域，图腾代表着人类崇高的文明与美好的信仰，图腾兽更是用神奇的力量帮助人类，那时人与图腾兽共生，天下太平。但一场战争的爆发却将美好的生活毁于一旦。而现在，被欲望所掌控的邪恶图腾师卷土重来，古老的图腾秘密穿越三千年再次复活，图腾兽被赋予新时代的信仰，带领机甲战士拯救世界的重任落在了五个小学生身上，而不同的性格和不同的追求，也让五个小图腾师拥有了专属于自己的独一无二的图腾兽。五人小队的图腾兽们不断进化机甲造型，不断掌握各种技能，而队友们的情谊也在不断成长，冒险途中虽然危机四伏却也惊喜连连。各种类型的图腾兽，奇异古怪的图腾之力，以及神奇美丽的图腾景观都在小朋友们的探险之路中一一展现，一个奇妙的图腾领域慢慢揭开神秘的面纱…
